Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms