Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Trappc6bQ9D289 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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