Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms