Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hddc3Q9D114 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms