Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F4

Nkap, NF-kappa-B-activating protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NkapQ9D0F4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NkapQ9D0F4 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms