Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms