Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms