Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms