Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ84

Ubl4b, Ubiquitin-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4bQ9CQ84 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ubl4bQ9CQ84 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ubl4bQ9CQ84 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ubl4bQ9CQ84 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ubl4bQ9CQ84 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ubl4bQ9CQ84 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ubl4bQ9CQ84 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ubl4bQ9CQ84 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ubl4bQ9CQ84 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ubl4bQ9CQ84 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ubl4bQ9CQ84 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ubl4bQ9CQ84 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ubl4bQ9CQ84 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ubl4bQ9CQ84 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ubl4bQ9CQ84 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ubl4bQ9CQ84 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubl4bQ9CQ84 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubl4bQ9CQ84 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubl4bQ9CQ84 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubl4bQ9CQ84 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubl4bQ9CQ84 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubl4bQ9CQ84 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubl4bQ9CQ84 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubl4bQ9CQ84 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubl4bQ9CQ84 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubl4bQ9CQ84 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubl4bQ9CQ84 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubl4bQ9CQ84 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubl4bQ9CQ84 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubl4bQ9CQ84 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubl4bQ9CQ84 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubl4bQ9CQ84 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubl4bQ9CQ84 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubl4bQ9CQ84 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubl4bQ9CQ84 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubl4bQ9CQ84 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubl4bQ9CQ84 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubl4bQ9CQ84 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubl4bQ9CQ84 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubl4bQ9CQ84 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubl4bQ9CQ84 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubl4bQ9CQ84 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubl4bQ9CQ84 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubl4bQ9CQ84 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubl4bQ9CQ84 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubl4bQ9CQ84 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubl4bQ9CQ84 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubl4bQ9CQ84 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubl4bQ9CQ84 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubl4bQ9CQ84 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubl4bQ9CQ84 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubl4bQ9CQ84 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubl4bQ9CQ84 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubl4bQ9CQ84 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubl4bQ9CQ84 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubl4bQ9CQ84 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubl4bQ9CQ84 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubl4bQ9CQ84 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubl4bQ9CQ84 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubl4bQ9CQ84 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubl4bQ9CQ84 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubl4bQ9CQ84 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ubl4bQ9CQ84 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ubl4bQ9CQ84 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ubl4bQ9CQ84 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubl4bQ9CQ84 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubl4bQ9CQ84 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubl4bQ9CQ84 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubl4bQ9CQ84 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubl4bQ9CQ84 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubl4bQ9CQ84 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubl4bQ9CQ84 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubl4bQ9CQ84 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubl4bQ9CQ84 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubl4bQ9CQ84 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubl4bQ9CQ84 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubl4bQ9CQ84 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubl4bQ9CQ84 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubl4bQ9CQ84 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubl4bQ9CQ84 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubl4bQ9CQ84 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubl4bQ9CQ84 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubl4bQ9CQ84 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubl4bQ9CQ84 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubl4bQ9CQ84 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubl4bQ9CQ84 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubl4bQ9CQ84 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubl4bQ9CQ84 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubl4bQ9CQ84 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubl4bQ9CQ84 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubl4bQ9CQ84 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubl4bQ9CQ84 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubl4bQ9CQ84 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubl4bQ9CQ84 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubl4bQ9CQ84 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubl4bQ9CQ84 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubl4bQ9CQ84 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubl4bQ9CQ84 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubl4bQ9CQ84 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubl4bQ9CQ84 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms