Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms