Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
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Use1Q9CQ56 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Use1Q9CQ56 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Use1Q9CQ56 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Use1Q9CQ56 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Use1Q9CQ56 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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Use1Q9CQ56 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Use1Q9CQ56 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Use1Q9CQ56 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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