Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPW0

Cntnap2, Contactin-associated protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap2Q9CPW0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Cntnap2Q9CPW0 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntnap2Q9CPW0 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntnap2Q9CPW0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntnap2Q9CPW0 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntnap2Q9CPW0 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntnap2Q9CPW0 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntnap2Q9CPW0 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntnap2Q9CPW0 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntnap2Q9CPW0 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms