Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd1bQ99JY6 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms