Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ddb2Q99J79 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ddb2Q99J79 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ddb2Q99J79 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ddb2Q99J79 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ddb2Q99J79 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ddb2Q99J79 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ddb2Q99J79 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ddb2Q99J79 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ddb2Q99J79 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 209.9 ms