Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms