Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD6

Vps36, Vacuolar protein-sorting-associated protein 36, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps36Q91XD6 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms