Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q8VDP2 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q8VDP2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q8VDP2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q8VDP2 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q8VDP2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q8VDP2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q8VDP2 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q8VDP2 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q8VDP2 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q8VDP2 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms