Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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