Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms