Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
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Trappc12Q8K2L8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Trappc12Q8K2L8 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Trappc12Q8K2L8 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Trappc12Q8K2L8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Trappc12Q8K2L8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Trappc12Q8K2L8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Trappc12Q8K2L8 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Trappc12Q8K2L8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Trappc12Q8K2L8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Trappc12Q8K2L8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Trappc12Q8K2L8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
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Trappc12Q8K2L8 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Trappc12Q8K2L8 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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