Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHI8

Ep400, E1A-binding protein p400, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,072 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep400Q8CHI8 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ep400Q8CHI8 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ep400Q8CHI8 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ep400Q8CHI8 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ep400Q8CHI8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ep400Q8CHI8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ep400Q8CHI8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ep400Q8CHI8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ep400Q8CHI8 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ep400Q8CHI8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ep400Q8CHI8 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ep400Q8CHI8 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ep400Q8CHI8 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ep400Q8CHI8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ep400Q8CHI8 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ep400Q8CHI8 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ep400Q8CHI8 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ep400Q8CHI8 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ep400Q8CHI8 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ep400Q8CHI8 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ep400Q8CHI8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ep400Q8CHI8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ep400Q8CHI8 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ep400Q8CHI8 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ep400Q8CHI8 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ep400Q8CHI8 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ep400Q8CHI8 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ep400Q8CHI8 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ep400Q8CHI8 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ep400Q8CHI8 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ep400Q8CHI8 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ep400Q8CHI8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ep400Q8CHI8 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ep400Q8CHI8 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ep400Q8CHI8 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ep400Q8CHI8 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ep400Q8CHI8 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ep400Q8CHI8 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ep400Q8CHI8 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ep400Q8CHI8 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ep400Q8CHI8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ep400Q8CHI8 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ep400Q8CHI8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ep400Q8CHI8 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ep400Q8CHI8 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ep400Q8CHI8 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ep400Q8CHI8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ep400Q8CHI8 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ep400Q8CHI8 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ep400Q8CHI8 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ep400Q8CHI8 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ep400Q8CHI8 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ep400Q8CHI8 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ep400Q8CHI8 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ep400Q8CHI8 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ep400Q8CHI8 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ep400Q8CHI8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ep400Q8CHI8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ep400Q8CHI8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ep400Q8CHI8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ep400Q8CHI8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ep400Q8CHI8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ep400Q8CHI8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ep400Q8CHI8 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ep400Q8CHI8 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ep400Q8CHI8 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ep400Q8CHI8 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ep400Q8CHI8 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ep400Q8CHI8 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ep400Q8CHI8 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ep400Q8CHI8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ep400Q8CHI8 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ep400Q8CHI8 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ep400Q8CHI8 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ep400Q8CHI8 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ep400Q8CHI8 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ep400Q8CHI8 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ep400Q8CHI8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ep400Q8CHI8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ep400Q8CHI8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ep400Q8CHI8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ep400Q8CHI8 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ep400Q8CHI8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ep400Q8CHI8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ep400Q8CHI8 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ep400Q8CHI8 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ep400Q8CHI8 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ep400Q8CHI8 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ep400Q8CHI8 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ep400Q8CHI8 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ep400Q8CHI8 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ep400Q8CHI8 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ep400Q8CHI8 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ep400Q8CHI8 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ep400Q8CHI8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ep400Q8CHI8 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ep400Q8CHI8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ep400Q8CHI8 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ep400Q8CHI8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ep400Q8CHI8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms