Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE33

Klhl11, Kelch-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl11Q8CE33 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms