Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Nhlrc3Q8CCH2 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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