Protein–RNA interactions for Protein: Q8C503

Sit1, Signaling threshold-regulating transmembrane adapter 1, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sit1Q8C503 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sit1Q8C503 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sit1Q8C503 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sit1Q8C503 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sit1Q8C503 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sit1Q8C503 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sit1Q8C503 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sit1Q8C503 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sit1Q8C503 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sit1Q8C503 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sit1Q8C503 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sit1Q8C503 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sit1Q8C503 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sit1Q8C503 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sit1Q8C503 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sit1Q8C503 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sit1Q8C503 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sit1Q8C503 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sit1Q8C503 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sit1Q8C503 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sit1Q8C503 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sit1Q8C503 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sit1Q8C503 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sit1Q8C503 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sit1Q8C503 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sit1Q8C503 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms