Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Znf428Q8C1M2 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf428Q8C1M2 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms