Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXQ8

Fam53c, Protein FAM53C, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam53cQ8BXQ8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam53cQ8BXQ8 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam53cQ8BXQ8 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam53cQ8BXQ8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam53cQ8BXQ8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam53cQ8BXQ8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam53cQ8BXQ8 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam53cQ8BXQ8 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam53cQ8BXQ8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam53cQ8BXQ8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam53cQ8BXQ8 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam53cQ8BXQ8 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam53cQ8BXQ8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam53cQ8BXQ8 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam53cQ8BXQ8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam53cQ8BXQ8 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam53cQ8BXQ8 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam53cQ8BXQ8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam53cQ8BXQ8 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam53cQ8BXQ8 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam53cQ8BXQ8 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam53cQ8BXQ8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam53cQ8BXQ8 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam53cQ8BXQ8 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam53cQ8BXQ8 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam53cQ8BXQ8 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam53cQ8BXQ8 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam53cQ8BXQ8 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam53cQ8BXQ8 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam53cQ8BXQ8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam53cQ8BXQ8 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam53cQ8BXQ8 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam53cQ8BXQ8 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam53cQ8BXQ8 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam53cQ8BXQ8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam53cQ8BXQ8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Fam53cQ8BXQ8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Fam53cQ8BXQ8 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam53cQ8BXQ8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam53cQ8BXQ8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam53cQ8BXQ8 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Fam53cQ8BXQ8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Fam53cQ8BXQ8 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Fam53cQ8BXQ8 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Fam53cQ8BXQ8 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Fam53cQ8BXQ8 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Fam53cQ8BXQ8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Fam53cQ8BXQ8 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Fam53cQ8BXQ8 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Fam53cQ8BXQ8 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Fam53cQ8BXQ8 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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