Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Rbbp5Q8BX09 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Rbbp5Q8BX09 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
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Rbbp5Q8BX09 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp5Q8BX09 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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