Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms