Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKS9

Pum3, Pumilio homolog 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pum3Q8BKS9 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pum3Q8BKS9 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pum3Q8BKS9 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms