Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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