Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.7 ms