Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Ttc28Q80XJ3 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Ttc28Q80XJ3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Ttc28Q80XJ3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Ttc28Q80XJ3 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Ttc28Q80XJ3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Ttc28Q80XJ3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Ttc28Q80XJ3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Ttc28Q80XJ3 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Ttc28Q80XJ3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Ttc28Q80XJ3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Ttc28Q80XJ3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Ttc28Q80XJ3 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Ttc28Q80XJ3 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Ttc28Q80XJ3 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Ttc28Q80XJ3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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