Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Zbed4Q80WQ9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Zbed4Q80WQ9 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Zbed4Q80WQ9 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Zbed4Q80WQ9 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Zbed4Q80WQ9 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Zbed4Q80WQ9 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Zbed4Q80WQ9 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Zbed4Q80WQ9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Zbed4Q80WQ9 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Zbed4Q80WQ9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms