Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms