Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Cgrrf1-203ENSMUST00000133989 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Ppp1r2-ps9-202ENSMUST00000173852 882 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Gm42995-201ENSMUST00000197047 1330 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Gm15940-201ENSMUST00000156011 817 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Scgb2a2-201ENSMUST00000179814 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Gm42479-201ENSMUST00000198654 1356 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ClmQ7TSN2 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms