Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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