Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prrc2bQ7TPM1 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms