Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms