Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms