Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Mir3060-201ENSMUST00000175339 83 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
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NipblQ6KCD5 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
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NipblQ6KCD5 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
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NipblQ6KCD5 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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