Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms