Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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