Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Jmjd1cQ69ZK6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Jmjd1cQ69ZK6 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Jmjd1cQ69ZK6 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Jmjd1cQ69ZK6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Jmjd1cQ69ZK6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Jmjd1cQ69ZK6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Jmjd1cQ69ZK6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Jmjd1cQ69ZK6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Jmjd1cQ69ZK6 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Jmjd1cQ69ZK6 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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