Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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