Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms