Protein–RNA interactions for Protein: Q62520

Zic2, Zinc finger protein ZIC 2, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic2Q62520 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zic2Q62520 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms