Protein–RNA interactions for Protein: Q62413

Epha6, Ephrin type-A receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha6Q62413 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Epha6Q62413 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms