Protein–RNA interactions for Protein: Q61481

Pde1a, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1A, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1aQ61481 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms