Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms