Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms